Баграту Третьему пришлось иметь дело с Византией, не желавшей самостоятельности Грузии. После кровавой войны в Тао-Кларджети, он признал ее власть и свою роль наместника на родине. В Грузии росли новые города – Ахалцихе, Ахалкалаки, Телави и отобранный у арабов Дманиси. Баграт построил в Кутаиси собор по примеру церкви Ошки в Артануджи. Мцхета и абхазская Бедия спорили за титул духовного центра страны, но Баграт уделял внимание обоим. В Мцхете он перестроил собор Светицховели, до этого разрушенный.
Процессу объединения сопротивлялись лидеры Кахетии и Эрети, области в нынешнем западном Азербайджане. Тбилиси старались пока не трогать. Он был густонаселенный, богатый, через него шла торговля, здесь развивались науки и искусства. Захват неминуемо привел бы к разрушениям и объединению мусульманских армий против Грузии. Баграт понимал, что новое государство еще слабо для такой войны.
Чтобы избежать смуты, Баграт Третий построил крепость Тмогви в долине реки Куры, куда заточил своих братьев из числа конкурентов за престол. Одни из них погибли, другие сбежали в Византию. После смерти Баграта в 1014 году новым царем стал его сын Георгий Первый. Как отцу, сыну вновь пришлось воевать с Византией, а также князьями Кахетии и Триалиети, которые вели себя все более дерзко. Правил он недолго.
В 1027 году, царем стал Баграт Четвертый. Триалетские князья Липариты постоянно осаждали Тбилиси и крепость Биртвиси, из-за чего в городе разразился голод, а мусульманские властители начали угрожать Грузии. Новому Баграту пришлось осаждать дворян и возвращать все обратно совету старейшин Тбилиси. В 1050-е годы появилась новая угроза – турки-сельджуки. Бывшие враги объединились с Багратом для борьбы с их вторжениями, которые волнами прокатывались по стране. Турки Арп-Арслана разграбили Тао-Калрджети и Южную Грузию и, если бы не суровая зима, то в 1068 году они бы уничтожили Кутаиси. К счастью, турки быстро переключили внимание на Византию, и Грузия ненадолго вздохнула с облегчением. В 1071 году Византийский император Роман Четвертый попал в плен и был убит ими. Турки захватили всю Анатолию к югу и западу от Грузии.
В 1062 году, епископ Руиси, написал знаменитый исторический труд «Жизнь Картли», древнейшую рукопись о жизни в Грузии. Страна процветала – расширился Иверский монастырь на Афоне, появился свой монастырь Креста в Иерусалиме, которому покровительствовали грузинские власти. Баграт умер в тот же год, что и турецкий лидер Арп-Арслан. Его сын, Георгий Второй Багратион, не мог сопротивляться новым вторжениям. С 1080-х годов началось Великое турецкое иго. Турки захватили Тбилиси и Тао-Кларджети, где начали расселяться с семьями, уничтожая хозяйства. Княжество Самцхе-Джавахети было опустошено. Сопротивление им оказывали дворяне рода Абуладзе (Абулетидзе), которые оборонялись в крепостях Мухрани и Зедазени. В конце концов, разорение достигло крайних пределов и Георгию Второму пришлось договориться с турками, чтобы они частично ушли в обмен на дань и солдат для их армии.
В печали, Георгий отрекся от престола и ушел в монастырь. Его изображение сохранилось в царском храме Атени. С 1089 года, престол единой Грузии наследовал его сын Давид Четвертый, более известный, как Строитель, или Восстановитель. Давид воспользовался смутой в землях турок после смерти их лидера и изгнал их из Грузии. Он ввел новую систему управления, в которой была своя служба безопасности. Благодаря ей, он знал обо всех заговорах и быстро устранял конкурентов. Крестьяне начали возвращаться в свои земли, страна восстанавливалась. Когда в 1095 году начался Первый крестовый поход, мусульманам стало не до Грузии, и Давид Строитель начал действовать.
